C#依赖注入作为一种广泛应用的编程技术，为开发者带来了诸多便利，但如同任何技术一样，它也并非完美无缺，存在一定的局限性。

在软件开发中，依赖注入有助于提高代码的可维护性和可测试性，当过度使用或者使用不当的时候，也可能会引发一些问题。

其一，复杂的依赖关系可能导致项目的理解和维护难度增加，如果在一个系统中存在大量的依赖注入，并且依赖关系错综复杂，那么对于新加入项目的开发者来说，理解这些依赖关系就会变得非常困难，这不仅会影响开发效率，还可能在后续的维护过程中引入错误。

其二，性能可能会受到一定的影响，虽然在大多数情况下，这种性能损失是微不足道的，但在一些对性能要求极高的场景中，例如实时处理大量数据的应用程序，依赖注入所带来的额外开销可能就不能被忽视。

其三，依赖注入框架本身可能存在一些限制，不同的依赖注入框架可能具有不同的特性和限制，选择不当可能无法满足项目的特定需求，某些框架可能在处理复杂的依赖关系或者特定的编程场景时表现不佳。

其四，错误的配置或使用可能导致运行时错误，如果依赖注入的配置不正确，或者在注入过程中出现了异常，那么可能会导致程序在运行时崩溃，给用户带来不好的体验。

对于小型项目或者简单的应用程序，引入依赖注入可能会增加不必要的复杂性，在这种情况下，传统的直接依赖可能更加简单和高效。

C#依赖注入虽然是一项强大的技术，但开发者在使用时需要充分考虑项目的实际需求和特点，合理地运用这一技术，以避免其局限性带来的潜在问题，从而实现更加高效、可靠的软件开发。